該保護區總面積為２３萬公頃，其中核心區１處面積為４萬公頃，實驗區面積為１７萬公頃，其主要保護對象是紅鰭?（地方俗稱白魚）。核心區特別保護期為每年的５月１日至７月３１日。紅鰭?是呼倫湖野生魚種，它以肉質鮮美、營養價值高，受到廣大消費者青睞。

    有關人士稱，通過種質資源保護區的建立，對紅鰭?等水生野生種群的增長和保護呼倫湖水系土著魚類種質資源具有重要意義。同時，也為呼倫湖野生鯉魚、鯽魚、鯰魚等其他優質水生野生物種提供良好的繁殖生長環境。該保護區的建成，對生物多樣性的保護，對呼倫湖的科學研究、水土保持、環境教育、生態旅游等功能有促進作用，對保護區漁業資源恢復國家級水產種質與發展都具有十分重要的意